Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Khdc3Q9CWU5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Khdc3Q9CWU5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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