Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms