Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms