Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Ifitm3Q9CQW9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifitm3Q9CQW9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms