Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms