Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms