Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Nicn1Q9CQM0 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms