Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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