Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Nudt21Q9CQF3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Nudt21Q9CQF3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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