Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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