Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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Rab5aQ9CQD1 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Rab5aQ9CQD1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Rab5aQ9CQD1 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Rab5aQ9CQD1 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Rab5aQ9CQD1 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Rab5aQ9CQD1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Rab5aQ9CQD1 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Rab5aQ9CQD1 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Rab5aQ9CQD1 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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