Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Chmp3Q9CQ10 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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