Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms