Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms