Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH0

Ankrd17, Ankyrin repeat domain-containing protein 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd17Q99NH0 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ankrd17Q99NH0 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ankrd17Q99NH0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ankrd17Q99NH0 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ankrd17Q99NH0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ankrd17Q99NH0 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ankrd17Q99NH0 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ankrd17Q99NH0 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ankrd17Q99NH0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ankrd17Q99NH0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
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Ankrd17Q99NH0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ankrd17Q99NH0 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ankrd17Q99NH0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ankrd17Q99NH0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ankrd17Q99NH0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ankrd17Q99NH0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ankrd17Q99NH0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ankrd17Q99NH0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ankrd17Q99NH0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ankrd17Q99NH0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ankrd17Q99NH0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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