Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms