Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Ubqln4Q99NB8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln4Q99NB8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln4Q99NB8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Ubqln4Q99NB8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Ubqln4Q99NB8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ubqln4Q99NB8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ubqln4Q99NB8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln4Q99NB8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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