Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a6cQ99N08 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms