Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6dQ99N07 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms