Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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