Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ddb2Q99J79 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ddb2Q99J79 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ddb2Q99J79 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ddb2Q99J79 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Ddb2Q99J79 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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