Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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