Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Smg8Q8VE18 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Smg8Q8VE18 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Smg8Q8VE18 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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