Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
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