Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup35Q8R4R6 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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