Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Vrk3Q8K3G5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Vrk3Q8K3G5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Vrk3Q8K3G5 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Vrk3Q8K3G5 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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