Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prkd3Q8K1Y2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prkd3Q8K1Y2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms