Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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