Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Nup88Q8CEC0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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