Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms