Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F5

Ttc16, Tetratricopeptide repeat protein 16, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc16Q8C1F5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ttc16Q8C1F5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ttc16Q8C1F5 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ttc16Q8C1F5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ttc16Q8C1F5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc16Q8C1F5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc16Q8C1F5 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc16Q8C1F5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc16Q8C1F5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ttc16Q8C1F5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc16Q8C1F5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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