Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms