Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

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Length 1,358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TnrQ8BYI9 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TnrQ8BYI9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TnrQ8BYI9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TnrQ8BYI9 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnrQ8BYI9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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