Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms