Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms