Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cep55Q8BT07 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep55Q8BT07 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep55Q8BT07 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep55Q8BT07 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep55Q8BT07 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep55Q8BT07 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep55Q8BT07 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep55Q8BT07 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep55Q8BT07 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep55Q8BT07 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep55Q8BT07 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep55Q8BT07 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep55Q8BT07 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep55Q8BT07 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep55Q8BT07 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep55Q8BT07 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep55Q8BT07 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep55Q8BT07 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep55Q8BT07 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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