Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Nop53Q8BK35 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Nop53Q8BK35 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Nop53Q8BK35 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Nop53Q8BK35 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop53Q8BK35 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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