Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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H2-M10.4Q85ZW8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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