Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms