Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srgap3Q812A2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms