Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms