Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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