Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115 ms