Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pcsk9Q80W65 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pcsk9Q80W65 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pcsk9Q80W65 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pcsk9Q80W65 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pcsk9Q80W65 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pcsk9Q80W65 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pcsk9Q80W65 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pcsk9Q80W65 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pcsk9Q80W65 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pcsk9Q80W65 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pcsk9Q80W65 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms