Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms