Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Tmeff1Q6PFE7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Tmeff1Q6PFE7 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Tmeff1Q6PFE7 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Tmeff1Q6PFE7 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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