Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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