Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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