Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms