Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms